Uno de los problemas que presenta el Aula Invertida es que el modelo de aplicación es muy genérico, solo se basa en agrupar un conjunto de actividades en torno a la “lección en casa” y otro conjunto de actividades en torno a los “deberes en clase”.
Este modelo genérico tiene ventajas y desventajas. Entre las ventajas citamos la flexibilidad y creatividad que permite, ya que al no definir las actividades concretas el profesorado tiene libertad para establecer las que considere más adecuadas. Como principal desventaja señalamos la gran variedad de modelos existentes en la actualidad, lo que puede ocasionar una cierta confusión entre el profesorado que desea comenzar a utilizar este método.
Así pues, es necesario clasificar los distintos modelos de aplicación para facilitar su estudio y la elección del más adecuado en cada caso.